1983年中山大学正式成立了全国最早的综合性港澳研究机构——港澳研究所;1991年在港澳研究所基础上建立的港澳研究中心被国家教委确定为香港问题研究布点机构。2000年9月,在港澳研究所与珠江三角洲研究所的基础上组建了港澳珠江三角洲研究中心,并正式入选为“教育部人文社会科学百所重点研究基地”;2004年港澳珠三角研究研究中心入选“985”工程二期哲学社会科学创新基地;2009年入选为“211”工程三期重点学科项目;2010年又入选为“985”工程三期提升自主创新和社会服务能力创新基地。而今,中山大学港澳珠江三角洲研究中心已拥有一支专职和兼职人员相结合的研究团队,汇聚经济学、社会学、政治学、管理学、人文地理学等多个学科的研究力量,针对港澳区域的重大问题进行综合性的研究。